Vid CeSam bedrivs forskning som stöds av externfinansierade forskningsanslag. För närvarande är ett sådant forskningsprojekt, Klimatet som utmaning – studenters lösningar på klimatproblem i ekonomi, statsvetenskap och juridik, placerat vid centret. Ansökningar om finansiering av ett större forskningsprogram, Conceptual change in the social sciences, har under våren lämnats in till Vetenskapsrådet och till Markus och Amalia Wallenbergs forskningsstiftelse.

För att stödja forskning om undervisning och lärande vid fakultetens ämnesinstitutioner har CeSam utlyst medel för arbete med ämnesdidaktiska kunskapsöversikter. Inför hösten 2012 har två sådana kunskapsöversikter påbörjats, en i psykologi och en i specialpedagogik. Interna utlysningar har tidigare gjorts för att stödja lärare och forskare inom fakultetens institutioner att skriva forskningsansökningar riktade till externa forskningsfinansiärer inom området undervisning och lärande till externa finansiärer.

Knutet till CeSam finns också ett antal doktorandprojekt. Några av projekten, i ämnena kulturgeografi, socialantropologi, psykologi och pedagogik, finansieras genom ett särskilt anslag från Samhällsvetenskapliga fakultetsnämnden och det fulla ansvaret för dessa ligger inom berörda ämnesinstitutioner. Dessa projekt utgör kärnan i det doktorandnätverk som stöds av CeSam där även pågående forskning på doktorandnivå om begreppsförändring vid Institutionen för pedagogik och didaktik ingår.